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玉米大斑病菌轉錄因子StMSN4基因的克隆及表達模式分析

李學然; 畢歡歡; 薛江芝; 李路陽; 王欣宇; 劉玉衛; 谷守芹; 韓建民 河北農業大學生命科學學院/河北省植物生理與分子病理學重點實驗室; 河北保定071000

關鍵詞:玉米大斑病菌 msn4 基因結構 

摘要:為明確玉米大斑病菌轉錄因子StMSN4基因的結構特征及其在病菌重要生長發育時期的表達模式,本試驗以釀酒酵母ScMSN4氨基酸序列為探針,在玉米大斑病菌基因組數據庫中搜索并克隆其同源基因,并對該基因的結構及其編碼蛋白的理化性質、空間結構等進行預測;通過分析病菌關鍵生長發育階段的RNA-Seq數據,明確該基因的表達模式。結果發現,在玉米大斑病菌基因組中搜索并克隆得到了ScMSN4的同源基因,將其命名為StMSN4;該基因DNA全長為1357 bp,cDNA全長為1296 bp,包含2個外顯子,1個內含子;其編碼蛋白包含431個氨基酸,含有2個典型ZnF-C2H2保守結構域。通過對病菌的菌絲、分生孢子、芽管、附著胞和侵入釘時等5個典型發育時期的RNA-Seq數據分析表明,StMSN4基因在5個發育時期均有表達,且表達水平較高,表明該基因在病菌的生長發育階段發揮著重要的作用。本研究不僅明確了StMSN4基因的結構特性及其表達模式,也為深入研究該基因的功能及HOG-MAPK信號轉導途徑的作用機制奠定了基礎。

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