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多頭帶絳蟲TPx基因的生物信息學(xué)簡析
關(guān)鍵詞：多頭帶絳蟲 硫氧還蛋白過氧化物酶 生物信息學(xué) 分子水平
摘要：從患病綿羊腦內(nèi)采集多頭蚴原頭節(jié),提取總RNA,采用RT-PCR技術(shù)擴(kuò)增多頭帶絳蟲硫氧還蛋白過氧化物酶(TmTPx)基因,PCR產(chǎn)物連接到pMD18-T載體,轉(zhuǎn)化至大腸埃希菌DH5α后測序,克隆到的TmTPx基因開放閱讀框?yàn)?91bp,編碼196個(gè)氨基酸。運(yùn)用DNASTAR、Rpsblast等軟件對TmTPx基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,能確定TmTPx的蛋白表面暴露區(qū)、蛋白骨架柔韌性、蛋白抗原指數(shù)、功能域等,利于從分子水平了解TmTPx的功能及多頭帶絳蟲的生理代謝、進(jìn)化分類。
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